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Il software di Microsoft ha quasi distrutto la prima Half-Life pochi mesi prima del rilascio.
Valve ha conservato il progetto e tutta la storia dei cambiamenti in Microsoft Visual SourceSafe, ma il database improvvisamente ha deciso di fare una penna e andare nei cieli digitali. Come risultato, gli sviluppatori hanno perso le prime versioni del gioco e quasi tutta la storia dello sviluppo dal 1996.
Il team ha dovuto letteralmente raccogliere Half-Life di nuovo dai file attuali che erano rimasti sui computer dei dipendenti. Il codice originale è stato salvato, ma gran parte dei materiali intermedi è scomparso per sempre.
Ironicamente, il primo gioco della società, fondato da Microsoft, è quasi morto a causa del programma Microsoft.